Khalidi est professeur de philosophie à la City University of New York Graduate Center. Il a travaillé sur les aspects philosophiques de la question de la Palestine, y compris les droits des réfugiés, le droit à l'autodétermination politique et l'éthique de la guerre. Il travaille également sur la philosophie des sciences et de la cognition, notamment sur la catégorisation dans les sciences naturelles et sociales et sur l'influence du langage sur la pensée. Il siège au comité exécutif  de l'Institut et préside le comité de recherches. Khalidi est l'éditeur de Manifestations of Identity: The Lived Reality of Palestinian Refugees in Lebanon (IPS, 2010), et a publié un certain nombre d'articles dans le Journal of Palestine Studies et Majallat al-Dirasat al-Filastiniyya.